تتكون كلية طب الاسنان جامعة سوهاج من الاقسام العلمية الاتية:
- قسم بيولوجيا الفم.
- قسم بثولوجيا الفم.
- قسم المواد الحيوية لطب الاسنان.
- قسم الاستعاضة الصناعية لطب الاسنان.
- قسم العلاج التحفظي للأسنان.
- قسم جراحة الفم و الوجه و الفكين.
- قسم طب الفم و امراض اللثة و التشخيص.
- قسم طب اسنان الاطفال و الصحة العامة.
- قسم تقويم الاسنان.
- قسم علاج الجذور.
- قسم اشعة الفم و الوجه و الفكين .